新技術(shù)正為推動(dòng)罕見病的篩查和診斷做出努力。4月21日,中科院北京基因組研究所陳華在CAS概念驗(yàn)證中心“概念驗(yàn)證創(chuàng)新大賽——醫(yī)療器械專場(chǎng)”上帶來了“罕見病輔助診斷系統(tǒng)”的路演。陳華介紹稱,大部分罕見病都與基因突變相關(guān),因此可以結(jié)合表型和基因型數(shù)據(jù),通過人工智能等機(jī)器學(xué)習(xí)的方法來推斷患者疾病類型及概率。
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據(jù)估算,中國(guó)罕見病患者人數(shù)約為1680萬(wàn)。全世界有超2.5億罕見病患者。陳華團(tuán)隊(duì)帶來的系統(tǒng)通過集成罕見病數(shù)據(jù)庫(kù)、開發(fā)二代測(cè)序數(shù)據(jù)分析算法、罕見病表型術(shù)語(yǔ)解析等工作,構(gòu)建了一個(gè)初步的罕見病診斷輔助系統(tǒng)。
合作伙伴的求助是陳華進(jìn)入這一領(lǐng)域的契機(jī)。此前有合作伙伴拿著患病家系的基因組數(shù)據(jù)來找他分析,當(dāng)時(shí)的病種是脆骨?。ㄓ址Q“瓷娃娃”),分析可知,脆骨病的發(fā)病機(jī)理比較明確,即骨膠原蛋白有一個(gè)非同義突變,讓其高級(jí)結(jié)構(gòu)被破壞,骨骼就沒辦法正常形成,容易經(jīng)常性骨折。在這個(gè)過程中,陳華接觸到這一領(lǐng)域并被吸引。
通過這件事,陳華覺得科研和病患的生活離得很近,如果觸手可及能做一些工作是一件好事。
目前80%以上的罕見病都是由遺傳和遺傳基因缺陷所導(dǎo)致,能有效治療的只占約5%,這些疾病往往給患者本身帶來極大的身心痛苦,也給其家庭帶來很大的負(fù)擔(dān)。
陳華認(rèn)為,種類多是罕見病難以確診的挑戰(zhàn)之一。對(duì)于大部分臨床醫(yī)生來說,他不能擁有非常廣博的知識(shí),對(duì)8千多種的罕見病都能夠有一個(gè)很好的認(rèn)識(shí)。另外,罕見病的表型極其復(fù)雜,因此42%以上罕見病患者都經(jīng)歷過誤診。
基于上述因素,陳華團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了罕見病的一個(gè)輔助診斷系統(tǒng)。這個(gè)系統(tǒng)一方面可以為醫(yī)生提供一個(gè)數(shù)據(jù)分析助手和提供診斷輔助信息,另一方面,從患者基因組的多態(tài)角度以及信息的解讀角度,為其提供一個(gè)輔助助手。
當(dāng)然,臨床病歷數(shù)據(jù)和專業(yè)的編審是完善“罕見病輔助診斷系統(tǒng)”的關(guān)鍵,盡管已收集了一些表型,但系統(tǒng)尚未在臨床使用。陳華下一步的計(jì)劃是希望推動(dòng)其在醫(yī)院的試點(diǎn)。
“我必須承認(rèn)一點(diǎn),我們這所有的東西都是閉門造車,沒有在醫(yī)院里面用過,也沒有臨床醫(yī)生介入,權(quán)威地幫我們進(jìn)行編審。最好希望每一類疾病都能找到相應(yīng)的專家,讓其深度介入;很多罕見病有多種亞型,那么不同亞型間的臨床表型癥狀不一樣,治療方式也不一樣。”陳華表示。
目前,“罕見病輔助診斷系統(tǒng)”在實(shí)驗(yàn)室里剛完成了開發(fā)的一個(gè)階段,下一步目標(biāo)是希望跟醫(yī)院進(jìn)行合作,對(duì)產(chǎn)品進(jìn)行完善,包括數(shù)據(jù)庫(kù)的完善。同時(shí),在合作過程中,不斷收集和增加實(shí)際的病例,包括專家診斷的案例,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行一個(gè)持續(xù)的積累,來提高系統(tǒng)準(zhǔn)確率,有條件的話也希望在醫(yī)院試點(diǎn)。對(duì)于“罕見病輔助診斷系統(tǒng)”,陳華希望不僅僅是純粹地做一個(gè)技術(shù),一個(gè)簡(jiǎn)單的診療系統(tǒng),而是這個(gè)系統(tǒng)的技術(shù)能作為一個(gè)支點(diǎn),服務(wù)于一線的專家和醫(yī)生,在和醫(yī)院或者說其他公益組織以及企業(yè)的合作過程中,成功建立既服務(wù)于醫(yī)生,也服務(wù)于患者和企業(yè)的平臺(tái)和智慧社區(qū)。
據(jù)悉,“CAS概念驗(yàn)證計(jì)劃”專項(xiàng)是在中國(guó)科學(xué)院科技創(chuàng)新發(fā)展中心(原北京分院)與北京市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、中關(guān)村科技園區(qū)管理委員會(huì)指導(dǎo)和支持下,由中科智匯工場(chǎng)負(fù)責(zé)開展,旨在加強(qiáng)原始創(chuàng)新,促進(jìn)基礎(chǔ)研究項(xiàng)目向市場(chǎng)化成熟項(xiàng)目發(fā)展,聚焦科技成果轉(zhuǎn)化的細(xì)分階段,支持和培育一批中國(guó)科學(xué)院院內(nèi)早期項(xiàng)目從實(shí)驗(yàn)室走向產(chǎn)業(yè)化。 北京商報(bào)記者 姚倩
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